La douleur et le gâteau

I don't know if you get to what extent your title is poetic and fun :)
It has the bittersweet taste of an oxymoron :)

Je savais déjà que mes anciennes chaussures de course étaient vieillusées car des petits trous oavaient commencé à apparaître.

Your sentence is correct though, but could a bit more natural with my suggestions.

Mais quand j'ai constaté que j'avais un peu mal aux pieds, je me suis dit, : "d'accord c'est l'heure de les remplacer".

If this is a quotation you have to use the quotation marks, if this is in the sentence then you have to rewrite a bit :
"Mais quand j'ai constaté que j'avais un peu mal aux pieds, je me suis dit qu'il était temps de les remplacer.".

Alors, après avoir fait un peu de recherche, il me sem j'ai fait quelques recherches. De ce que j'ai lu, Il est possible que j'ai développé une tendinite achililéenne.

Ça me fait de la peine car je sais déjà que je dvais devoisr arrêter de courir 2-entre 2 et 4 semaines.

"Il will have to ~ je vais devoir" : this is what we would use in such a context where you explain what is pending.

Je ferai du yoga mais ce n'est pas le même plaisir.

The sentence is perfect.
You can add "à la place" to enforce that you will have this activity *instead*.

Cependant, je sais que je dois le prendre cela au sérieux ; quand je me suis blessée à la hanche c'était l'horreur.

J'ai été retardée très longtemps à cause de cela.

On comprend mal ce que vous entendez par "retardé".
"A cause de cela je n'ai pas pu courir pendant un très long moment." ?

En plus, je commence à avoir mal aux doigts àde la main droite les matins.

C'est comme ça dequand on prendre de l'âge, peut-êtrj'imagine.

plus naturel

On n'a pas rendu visite à la marraine de mon mari depuis qu'on est rentrés suren ville.

On dit aussi parfois "sur la ville", mais plus généralement quand on va quelque part : "tu vas sur paris ?". Quand on rentre c'est plus rare, surtout quand on est déjà sur place.

Je savais déjà que mes anciennes chaussures de course étaient vieilles/usées car des petits trous ont commencé à apparaître.

usé = worn out (abîmé par l'usage)
Cela transmettrait encore mieux l'idée que vous voulez faire passer

Mais quand j'ai constaté que j'avais un peu mal aux pieds, je me suis dit, « d'accord c'est l'heure, il est temps de les remplacer. »

Discours direct = guillemets
« il est l'heure de » s'utilise plutôt quand on doit faire quelque chose au sens moral ou parce que c'est une sorte de normalité (c'est une petite subtilité)

Hélàas !

Alors, après avoir fait un peu dequelques recherches, il me semble que j'ai développé une tendinite achilienne.

« recherche » est un mot dénombrable en français, et quand on cherche plusieurs informations (ex quand on tape plusieurs choses sur Google, quand on visite plusieurs sites...), on le met au pluriel

Ça me fait de la peine car je sais déjà que je dois arrêter de courir 2-4 semaines.

« quinze jours/un mois » serait beaucoup plus idiomatique à mon sens, mais ce que vous avez écrit reste juste

Cependant, je sais que je dois le prendre ça/cette condition au sérieux ; quand je me suis blessée à la hanche, c'était l'horreur.

Étant donné que le sujet se trouve quand même assez loin en arrière dans le texte, à la rigueur j'utiliserais « ça » ou alors (encore mieux) je repréciserais carrément le sujet

Accord féminin => quand je me suis blesséE

J'ai été retardée très longtemps (dans mes projets) à cause de cela.

Même chose ici, accord obligatoire avec un passif => j'ai été retardéE
C'est plus une remarque discursive que proprement grammaticale, mais un lecteur se demanderait ici dans quoi vous avez été retardée ; si vous avez pris du retard au sens général, personnellement, je mettrais quand même « dans mes projets »

EnDe plus, je commence à avoir mal aux doigts àde la main droite les(s) matins(s).

Ici ce ne serait pas très grave, mais dans un texte, mieux vaut prendre l'habitude d'utiliser au moins « DE plus »

Il me semble que c'est à cause du nettoyage que je faits souvent.

-t n'est jamais une terminaison de la première personne du singulier => je faiS, tu faiS, il faiT

C'est comme ça de prendre de l'âge, peut-être.

Alternative un peu plus familière => J'imagine que c'est comme ça, quand on devient vieux

On n'a pas rendu visite à la marraine de mon mari depuis qu'on est rentrés suren ville.

« sur ville » n'existe pas