Ich habe eine sehr schwere Prüfung am Freitag, aber fühle ich mich sehr unmotiviert.

Wenn Du im zweiten Teilsatz das "ich" nochmals verwenden möchtest, muss es wie folgt lauten:
"..., aber ich fühle mich sehr unmotiviert."

Es hat auch nichts zu tun mit dem Arbeitsbereich, in dem ich arbeiten möchte.

"indem" ist eine Konjunktion, die eine Art und Weise bezeichnet. "in dem", was hier korrekt ist, ist einfach eine Präposition mit einem Relativpronomen.
"Die Polizei konnte den Täter überführen, indem seine Handydaten analysiert wurden."
"Das Haus, in dem wir leben, wurde 1975 erbaut."

Ich wünschte, dass ich nur dien Modulen wählen könnte, die mich wirklich interessieren, aber die Uni ist einfach so.

Ich war damit einverstanden, als ich mich entschieden habe zu studieren.

Ich wünschte, dass dieses Semester meine letztes wäre, aber ich muss noch zwei Semestern studieren.

Eigentlich sollte dieses Semester mein letztes sein, aber weil ich letztes Jahr in Berlin war, sollmuss ich noch ein Jahr studieren.