今日帰ってから昼寝を５時間をしてしまいました。

５時間というと昼寝と言えるかなあ　😂

その時期でにはずっと眠りには問題が全くなかったです。

でも仕事に戻っている今はいきなり眠りの問題が出てきますした。

合わなタイミングが悪いときに眠い

「都合が悪い時に眠い」「不都合な時に眠い」などでもいいです。

今日帰ってから昼寝を５時間をもしてしまいました。

This も expresses that the amount or duration is surprisingly large or more than expected.
You don't have to use も, but if you don't use it, を after 5時間 should be removed. 「昼寝を5時間してしまいました。）
(I think it's more natural to use も.)

前夜よく寝眠れなかったんです。

どうなったしてこうなるんだろうか（か）…

どうなったんだろう（か） is more like "I wonder what happened."

ケガのせいで、長い時間仕事ができませんでした。

Without ‘でした,’ it sounds like you still can’t work.

その時期ではずっと睡眠りには問題が全くなかったです。

でも仕事に戻っている（or 戻った）今はいきなり眠り睡眠の問題が出てきますした。