船员们很惊讶，实际这让真正的船长并不开心。

然后认识误解了船长的意思。

船员告诉富人这个病房是他的卧室，如果他是船长他得睡在这里。

船员们很惊讶，实际真正的船长也不开心。

船长要求一个船员送富人去船长室。

船员很困惑，因为船长平常和别的船员在一起睡觉，没有自己（单独）的卧室。

然后认识但他后来猜到了船长的意思。

这个卧室只有一个张床，一个水桶，空气闻起来像呕吐物。

船员告诉富人病房是他，这个房间就是船长的卧室，如果他是船长，他得睡在这里。

病房 is patient room

船员们很惊讶，实际的真船长不开心。

改成“真”也挺奇怪的……大致明白意思，就是原本的船长不开心对吧？
总之“实际的船长”听上去很迷惑。

船长求让一个船员送富人去船长室。

“求”有点像“恳求”
“让”->“ask”
“求”->“plead”

船员很困惑，因为船长平常和别的船员一起睡觉，没有自己的卧室。

严格来说没错。加“一起”感觉顺。
而且“和……睡觉”有歧义。

然后认识明白船长的意思。

“明白”也可以用“意识到”。用“才明白”语气会更缓一点。

这个卧室只有一个张床，一个水桶，闻起来像呕吐物。

量词错啦

船员告诉富人病房是他的卧室，如果他富人是船长他得睡在这里。

“他”太多了，指代的对象不明。（也就是说，读者容易弄混“他”指的是富人还是船长）