まず、たくさんお買い物をしました、。特にお土産です。

彼は医学部を卒業したばかり、で、私と同じように日本にも旅行していました。

私と同じ大学でしたが、（今回は初見）初対面でした。

私たちは彼を東京に都内を案内しました。

私たちは彼を can be omitted because Japanese readers should understand the subject and the object from the context.

最後、東京に戻って行きました。

まず、たくさんお買い物をしました、。特にお土産。

彼は医学部を卒業したばかりで、日本にも旅行しに来ていました。

私と同じ大学でしたが、今回は初見で初めて会いました。

私たちは彼をに東京にを案内しました。

最後に、東京にへ戻って行きました。

まず、たくさんお買い物をしました、特にお土産を買いました。

彼は医学を卒業したばかりで、日本にも旅行していました。

秋葉原と明治神宮に行ったり、おまかせを食べたり、お酒を飲んだりしました。

次の日、友達とその友達に会いました。

文脈からして２人に会い、彼らと行動を共にしたということですね。

私と同じ大学でしたが、今回は初見でめて会いました。

私たちは彼を東京にを案内しました。

秋葉原と明治神宮に行ったり、おまかせ店でおまかせの料理を食べたり、お酒を飲んだりしました。

最後、東京に戻って行きりました。

まず、たくさんお買い物をしました、特にお土産をたくさん買いました。

彼は医学部を卒業したばかりで、日本にもの旅行もしていました。

私と同じ大学でしたが、今回は初見で初めて会いました。

私たちは彼を東京に案内しました。

秋葉原と明治神宮に行ったり、おまかせ料理を食べたり、お酒を飲んだりしました。

最後、東京に戻って行き来ました。

彼は医学部を卒業したばかりで、日本にも旅行しに来ていました。

私と同じ大学でしたが、今回は初見で始めて会いました。

最後に、東京に戻って行き来ました。

「戻って行きました」だと、例えば、shorterさんが広島に残り、友だちがshorterさんから離れて東京に帰る、という感じになりますね。
東京が出発地だったなら、「東京に戻ってきた」あるいは「東京に戻った」でいいと思います。

彼は医学部を卒業したばかりで、日本にも旅行しで来ていました。

私と同じ大学でしたが、今回は初見が初対面でした。

人と初めて会う時は「初対面」のほうがよく使われますね。