我昨天才开始使用这个名为toggl的应用程序（app），用于跟追踪时间。

We usually just say 'app' in Chinese to refer to an application

我不想再浪费时间还想提高，并且我希望能提高自己的中文的水平。

刚开始用的是时候有点糊涂，但现在用起来感觉很有帮助。

我昨天才开始使用这个名为toggl的应用程序用于来跟踪时间。

来：for something, to do something
I see that Tammy replaced "this" with "one", but your translation is not wrong.
But actually if you say "this", you have to show me THE toggl in person. With "one", you don't have to.
Sorry to split hairs.

我昨天才开始使用这一个名为toggl的应用程序用于来跟踪时间。

我不想再浪费时间，还想提高中文的水平。

刚开始用的是时候有点糊涂，但现在用起来感觉很有帮助。