この投稿で様々な言葉のについて質問があります。

この３対でつの組み合わせは、それぞれどんな違いがありますか？

「材木　と　木材」

これらの違いは日本人の間でも曖昧です。
「材木」は一般的に、建築物や家具などの材料として一定のサイズに切り分けられたものを指します。
「木材」は、その他の雑多な用途に使われます。日常会話で使われるのは「木材」の方です。

「たまに　と　時々」

ほぼ同じ意味ですが、「たまに」の方がランダムで口語的な印象が少しあります。

「練習　と　訓練」

「訓練」は、何らかの非常事態を想定して行われます。例えば、「避難訓練」
「練習」は、何らかのスキルを上達させるために繰り返し行われます。例えば、「サッカーの練習」
日常生活では「練習」が使われることがほとんどです。

最後でに、どんな時でに「今日」がに対して「は」（今日は）を必要でとしますか？

まず、挨拶は「こんにちは」ですね。

文章中で「今日は、〜」とした場合は、他の日とは違ってしたことが僅かに強調されます。
例えば、「今日は、（毎日食べるわけではない）カレーを食べた。」
「今日、〜」とした場合は、今日という日には特に意味がないことが多い印象です。
例えば、「今日、通勤の途中でカブトムシを見つけた。」
明確に違いがないので、これ以上はうまく説明できません（泣）

他の時間の（昨日や明日といった）他の時間に関する言葉がも同じルールですか？

同じです。